Thomas D. Otto

Geciteerd door

	Alles	Sinds 2019
Citaties	19832	11058
h-index	66	52
i10-index	119	109

2200

1100

550

1650

20102011201220132014201520162017201820192020202120222023202483 173 358 611 1019 1250 1526 1652 1864 1927 1881 2152 1900 1788 1402

Openbare toegang

Alles bekijken

106 artikelen

0 artikelen

beschikbaar

niet beschikbaar

Op basis van financieringsmachtigingen

Medeauteurs

Prof. Matthew BerrimanSchool of Infection and Immunity, University of GlasgowGeverifieerd e-mailadres voor glasgow.ac.uk
Julian RaynerDirector, Cambridge Institute for Medical Research, University of CambridgeGeverifieerd e-mailadres voor cam.ac.uk
arnab painProfessor, KAUST; Distinguished Professor, Hokkaido UniversityGeverifieerd e-mailadres voor kaust.edu.sa
Martin HuntNuffield Department of Medicine, University of Oxford / European Bioinformatics InstituteGeverifieerd e-mailadres voor ebi.ac.uk
Simon R. HarrisSenior Program Officer, Bill & Melinda Gates FoundationGeverifieerd e-mailadres voor sanger.ac.uk
Wim DegravePesquisador Titular, Instituto Oswaldo Cruz, FiocruzGeverifieerd e-mailadres voor fiocruz.br
Min ZhangUniversity of South FloridaGeverifieerd e-mailadres voor usf.edu
Heinrich Magnus ManskeSenior Staff Scientist, Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, UKGeverifieerd e-mailadres voor sanger.ac.uk
Adam James ReidUniversity of CambridgeGeverifieerd e-mailadres voor cam.ac.uk
Isheng Jason Tsai 蔡怡陞Academia SinicaGeverifieerd e-mailadres voor gate.sinica.edu.tw
Andrew P JacksonReader in Parasitology, Institute of Infection and Global Health, University of LiverpoolGeverifieerd e-mailadres voor liv.ac.uk
Manuel LlinásDistinguished Professor of Biochemistry & Molecular Biology, The Pennsylvania State UniversityGeverifieerd e-mailadres voor psu.edu
James CottonSBOHVM, University of GlasgowGeverifieerd e-mailadres voor glasgow.ac.uk
Thomas KeaneResearch and Services Group LeaderGeverifieerd e-mailadres voor ebi.ac.uk
Guilherme OliveiraInstituto Tecnológico ValeGeverifieerd e-mailadres voor itv.org
Dorothee AuerProfessor of Neuroimaging, University of NottinghamGeverifieerd e-mailadres voor nottingham.ac.uk
Stephen BentleyWellcome Sanger InstituteGeverifieerd e-mailadres voor sanger.ac.uk

Volgen

Thomas D. Otto

University of Glasgow

Geverifieerd e-mailadres voor glasgow.ac.uk - Homepage

Big Data Algorithms single cell


Titel Sorteren op citaties Sorteren op jaar Sorteren op titel	Geciteerd door Geciteerd door	Jaar
A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion Torrent, Pacific Biosciences and Illumina MiSeq sequencers MA Quail, M Smith, P Coupland, TD Otto, SR Harris, TR Connor, A Bertoni, ... BMC genomics 13, 1-13, 2012	2799	2012
Circlator: automated circularization of genome assemblies using long sequencing reads M Hunt, ND Silva, TD Otto, J Parkhill, JA Keane, SR Harris Genome biology 16, 1-10, 2015	962	2015
Uncovering the essential genes of the human malaria parasite Plasmodium falciparum by saturation mutagenesis M Zhang, C Wang, TD Otto, J Oberstaller, X Liao, SR Adapa, K Udenze, ... Science 360 (6388), eaap7847, 2018	848	2018
Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species JOK Keith R Bradnam, Joseph N Fass, Anton Alexandrov GigaScience 2 (10), 2013	811	2013
Two Nonrecombining Sympatric Forms of the Human Malaria Parasite Plasmodium ovale Occur Globally CJ Sutherland, N Tanomsing, D Nolder, M Oguike, C Jennison, ... The Journal of infectious diseases 201 (10), 1544-1550, 2010	569	2010
Chromosome and gene copy number variation allow major structural change between species and strains of Leishmania MB Rogers, JD Hilley, NJ Dickens, J Wilkes, PA Bates, DP Depledge, ... Genome research 21 (12), 2129-2142, 2011	537	2011
ABACAS: algorithm-based automatic contiguation of assembled sequences S Assefa, TM Keane, TD Otto, C Newbold, M Berriman Bioinformatics 25 (15), 1968-1969, 2009	531	2009
A Systematically Improved High Quality Genome and Transcriptome of the Human Blood Fluke Schistosoma mansoni AV Protasio, IJ Tsai, A Babbage, S Nichol, M Hunt, MA Aslett, N De Silva, ... PLoS neglected tropical diseases 6 (1), e1455, 2012	490	2012
Distinct synovial tissue macrophage subsets regulate inflammation and remission in rheumatoid arthritis S Alivernini, L MacDonald, A Elmesmari, S Finlay, B Tolusso, MR Gigante, ... Nature medicine 26 (8), 1295-1306, 2020	472	2020
A cascade of DNA-binding proteins for sexual commitment and development in Plasmodium A Sinha, KR Hughes, KK Modrzynska, TD Otto, C Pfander, NJ Dickens, ... Nature 507 (7491), 253-257, 2014	472	2014
REAPR: a universal tool for genome assembly evaluation M Hunt, T Kikuchi, M Sanders, C Newbold, M Berriman, TD Otto Genome biology 14, 1-10, 2013	472	2013
A novel multiple-stage antimalarial agent that inhibits protein synthesis B Baragaña, I Hallyburton, MCS Lee, NR Norcross, R Grimaldi, TD Otto, ... Nature 522 (7556), 315-320, 2015	464	2015
New insights into the blood‐stage transcriptome of Plasmodium falciparum using RNA‐Seq TD Otto, D Wilinski, S Assefa, TM Keane, LR Sarry, U Böhme, J Lemieux, ... Molecular microbiology 76 (1), 12-24, 2010	459	2010
Genomic Insights into the Origin of Parasitism in the Emerging Plant Pathogen Bursaphelenchus xylophilus T Kikuchi, JA Cotton, JJ Dalzell, K Hasegawa, N Kanzaki, P McVeigh, ... PLoS pathogens 7 (9), e1002219, 2011	456	2011
RATT: rapid annotation transfer tool TD Otto, GP Dillon, WS Degrave, M Berriman Nucleic acids research 39 (9), e57-e57, 2011	359	2011
Improving draft assemblies by iterative mapping and assembly of short reads to eliminate gaps IJ Tsai, TD Otto, M Berriman Genome biology 11, 1-9, 2010	358	2010
A comprehensive evaluation of rodent malaria parasite genomes and gene expression TD Otto, U Böhme, AP Jackson, M Hunt, B Franke-Fayard, ... BMC biology 12, 1-18, 2014	309	2014
Optimizing Illumina next-generation sequencing library preparation for extremely AT-biased genomes SO Oyola, TD Otto, Y Gu, G Maslen, M Manske, S Campino, DJ Turner, ... BMC genomics 13, 1-12, 2012	267	2012
Iterative Correction of Reference Nucleotides (iCORN) using second generation sequencing technology TD Otto, M Sanders, M Berriman, C Newbold Bioinformatics 26 (14), 1704-1707, 2010	266	2010
Robust high-throughput prokaryote de novo assembly and improvement pipeline for Illumina data AJ Page, N De Silva, M Hunt, MA Quail, J Parkhill, SR Harris, TD Otto, ... Microbial genomics 2 (8), e000083, 2016	250	2016

Het systeem kan de bewerking nu niet uitvoeren. Probeer het later opnieuw.

Artikelen 1–20

Citaties per jaar

Dubbele citaties

Samengevoegde citaties

Medeauteurs toevoegenMedeauteurs

Volgen

Geciteerd door

Medeauteurs