Thomas A. Hopf

Geciteerd door

	Alles	Sinds 2019
Citaties	6869	4253
h-index	22	21
i10-index	23	23

920

460

230

690

201220132014201520162017201820192020202120222023202437 194 312 394 423 528 682 681 742 913 792 867 257

Openbare toegang

Alles bekijken

20 artikelen

1 artikel

beschikbaar

niet beschikbaar

Op basis van financieringsmachtigingen

Medeauteurs

Debora MarksSystems Biology, Harvard Medical School, Broad Institute of Harvard and MITGeverifieerd e-mailadres voor hms.harvard.edu
Chris SanderHarvard Medical School, Broad Institute, Dana-Farber Cancer Institute, Memorial Sloan KetteringGeverifieerd e-mailadres voor sanderlab.org
Charlotta ScharfePrincipal Data Scientist, F. Hoffmann-La Roche, SwitzerlandGeverifieerd e-mailadres voor roche.com
John IngrahamGenerate Biomedicines, IncGeverifieerd e-mailadres voor csail.mit.edu
Anna G. GreenAssistant Professor, Manning College of Information and Computer Sciences, UMass, AmherstGeverifieerd e-mailadres voor umass.edu
Burkhard RostProfessor of Computer Science & Computational Biology & Bioinformatics, TUM, MunichGeverifieerd e-mailadres voor tum.de
Andrea PagnaniProfessor at DISAT - Politecnico di Torino, and PI at the IIGMGeverifieerd e-mailadres voor polito.it
Riccardo Zecchinaprofessor, theoretical physics, Bocconi UniversityGeverifieerd e-mailadres voor unibocconi.it
Frank PoelwijkGenerate Biomedicines LLCGeverifieerd e-mailadres voor generatebiomedicines.com
Michael Springerharvard medical schoolGeverifieerd e-mailadres voor hms.harvard.edu
Oliver KohlbacherProfessor for Applied Bioinformatics, University of TübingenGeverifieerd e-mailadres voor uni-tuebingen.de
Agnes Toth-PetroczyMPI of Molecular Cell Biology and Genetics and Center for Systems Biology DresdenGeverifieerd e-mailadres voor mpi-cbg.de
Benjamin SchubertGroup Leader, ICB@Helmholtz Center MunichGeverifieerd e-mailadres voor helmholtz-muenchen.de
Matúš KalašSenior Engineer / Infrastructure Scientist, Department of Informatics, University of BergenGeverifieerd e-mailadres voor uib.no
Richard BentonUniversity of LausanneGeverifieerd e-mailadres voor unil.ch
Gaetano T Montelione, Constellation...Rensselaer Polytechnic InstituteGeverifieerd e-mailadres voor rpi.edu
Maximilian HechtAmazon.com Inc.Geverifieerd e-mailadres voor rostlab.org
Peter HönigschmidDepartment of Genome-Oriented Bioinformatics, TUM, WeihenstephanGeverifieerd e-mailadres voor wzw.tum.de
Stefan SeemayerBioinformatician at BASF SEGeverifieerd e-mailadres voor seemayer.de
Denis KrompassSiemens AGGeverifieerd e-mailadres voor siemens.com

Volgen

Thomas A. Hopf

Scientific Consultant

Geverifieerd e-mailadres voor thomashopf.com

Computational Biology


Titel Sorteren op citaties Sorteren op jaar Sorteren op titel	Geciteerd door Geciteerd door	Jaar
Protein 3D structure computed from evolutionary sequence variation DS Marks, LJ Colwell, R Sheridan, TA Hopf, A Pagnani, R Zecchina, ... PloS one 6 (12), e28766, 2011	1217	2011
A large-scale evaluation of computational protein function prediction P Radivojac, WT Clark, TR Oron, AM Schnoes, T Wittkop, A Sokolov, ... Nature methods 10 (3), 221-227, 2013	1035	2013
Protein structure prediction from sequence variation DS Marks, TA Hopf, C Sander Nature biotechnology 30 (11), 1072-1080, 2012	696	2012
Three-dimensional structures of membrane proteins from genomic sequencing TA Hopf, LJ Colwell, R Sheridan, B Rost, C Sander, DS Marks Cell 149 (7), 1607-1621, 2012	590	2012
A deep proteome and transcriptome abundance atlas of 29 healthy human tissues D Wang, B Eraslan, T Wieland, B Hallström, T Hopf, DP Zolg, J Zecha, ... Molecular systems biology 15 (2), e8503, 2019	588	2019
Mutation effects predicted from sequence co-variation TA Hopf, JB Ingraham, FJ Poelwijk, CPI Schärfe, M Springer, C Sander, ... Nature biotechnology 35 (2), 128-135, 2017	587	2017
Sequence co-evolution gives 3D contacts and structures of protein complexes TA Hopf, CPI Schärfe, JP Rodrigues, AG Green, O Kohlbacher, C Sander, ... elife 3, e03430, 2014	525	2014
A systematic p53 mutation library links differential functional impact to cancer mutation pattern and evolutionary conservation E Kotler, O Shani, G Goldfeld, M Lotan-Pompan, O Tarcic, A Gershoni, ... Molecular cell 71 (1), 178-190. e8, 2018	241	2018
The EVcouplings Python framework for coevolutionary sequence analysis TA Hopf, AG Green, B Schubert, S Mersmann, CPI Schärfe, JB Ingraham, ... Bioinformatics 35 (9), 1582-1584, 2019	209	2019
FreeContact: fast and free software for protein contact prediction from residue co-evolution L Kaján, TA Hopf, M Kalaš, DS Marks, B Rost BMC bioinformatics 15, 1-6, 2014	191	2014
Meltome atlas—thermal proteome stability across the tree of life A Jarzab, N Kurzawa, T Hopf, M Moerch, J Zecha, N Leijten, Y Bian, ... Nature methods 17 (5), 495-503, 2020	177	2020
Structured states of disordered proteins from genomic sequences A Toth-Petroczy, P Palmedo, J Ingraham, TA Hopf, B Berger, C Sander, ... Cell 167 (1), 158-170. e12, 2016	149	2016
Amino acid coevolution reveals three-dimensional structure and functional domains of insect odorant receptors TA Hopf, S Morinaga, S Ihara, K Touhara, DS Marks, R Benton Nature communications 6 (1), 6077, 2015	138	2015
Structure of the peptidoglycan polymerase RodA resolved by evolutionary coupling analysis M Sjodt, K Brock, G Dobihal, PDA Rohs, AG Green, TA Hopf, AJ Meeske, ... Nature 556 (7699), 118-121, 2018	128	2018
Protein structure determination by combining sparse NMR data with evolutionary couplings Y Tang, YJ Huang, TA Hopf, C Sander, DS Marks, GT Montelione Nature methods 12 (8), 751-754, 2015	87	2015
Quantification and discovery of sequence determinants of protein‐per‐mRNA amount in 29 human tissues B Eraslan, D Wang, M Gusic, H Prokisch, BM Hallström, M Uhlén, ... Molecular systems biology 15 (2), e8513, 2019	72	2019
Homology-based inference sets the bar high for protein function prediction T Hamp, R Kassner, S Seemayer, E Vicedo, C Schaefer, D Achten, F Auer, ... BMC bioinformatics 14, 1-10, 2013	59	2013
Quantification of the effect of mutations using a global probability model of natural sequence variation TA Hopf, JB Ingraham, FJ Poelwijk, M Springer, C Sander, DS Marks arXiv preprint arXiv:1510.04612, 2015	37	2015
Evfold. org: Evolutionary couplings and protein 3d structure prediction R Sheridan, RJ Fieldhouse, S Hayat, Y Sun, Y Antipin, L Yang, T Hopf, ... biorxiv, 021022, 2015	33	2015
PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data Nucleic acids research 50 (D1), D534-D542, 2022	32	2022

Het systeem kan de bewerking nu niet uitvoeren. Probeer het later opnieuw.

Artikelen 1–20

Citaties per jaar

Dubbele citaties

Samengevoegde citaties

Medeauteurs toevoegenMedeauteurs

Volgen

Geciteerd door

Medeauteurs